Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ScapQ6GQT6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScapQ6GQT6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ScapQ6GQT6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ScapQ6GQT6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ScapQ6GQT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScapQ6GQT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScapQ6GQT6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScapQ6GQT6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms