Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ric1Q69ZJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ric1Q69ZJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ric1Q69ZJ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ric1Q69ZJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ric1Q69ZJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ric1Q69ZJ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ric1Q69ZJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ric1Q69ZJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Ric1Q69ZJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ric1Q69ZJ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ric1Q69ZJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ric1Q69ZJ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ric1Q69ZJ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ric1Q69ZJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms