Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms