Protein–RNA interactions for Protein: Q64261

Cdk6, Cyclin-dependent kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk6Q64261 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk6Q64261 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk6Q64261 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk6Q64261 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk6Q64261 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk6Q64261 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk6Q64261 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk6Q64261 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk6Q64261 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk6Q64261 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk6Q64261 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk6Q64261 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk6Q64261 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms