Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim24Q64127 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim24Q64127 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim24Q64127 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim24Q64127 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim24Q64127 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim24Q64127 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms