Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScxQ64124 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScxQ64124 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScxQ64124 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScxQ64124 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScxQ64124 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScxQ64124 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScxQ64124 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScxQ64124 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScxQ64124 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScxQ64124 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScxQ64124 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScxQ64124 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms