Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms