Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sf3a2Q62203 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a2Q62203 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3a2Q62203 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3a2Q62203 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a2Q62203 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms