Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx3xQ62167 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ddx3xQ62167 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx3xQ62167 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx3xQ62167 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx3xQ62167 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx3xQ62167 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx3xQ62167 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx3xQ62167 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx3xQ62167 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx3xQ62167 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddx3xQ62167 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx3xQ62167 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ddx3xQ62167 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx3xQ62167 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx3xQ62167 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx3xQ62167 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms