Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aldh1a2Q62148 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aldh1a2Q62148 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aldh1a2Q62148 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aldh1a2Q62148 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aldh1a2Q62148 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aldh1a2Q62148 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aldh1a2Q62148 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms