Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ltbp3Q61810 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ltbp3Q61810 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ltbp3Q61810 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltbp3Q61810 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp3Q61810 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp3Q61810 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp3Q61810 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms