Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Itga6Q61739 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Itga6Q61739 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Itga6Q61739 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Itga6Q61739 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Itga6Q61739 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Itga6Q61739 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itga6Q61739 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Itga6Q61739 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms