Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dsg1aQ61495 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dsg1aQ61495 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dsg1aQ61495 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dsg1aQ61495 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dsg1aQ61495 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dsg1aQ61495 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dsg1aQ61495 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dsg1aQ61495 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dsg1aQ61495 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dsg1aQ61495 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dsg1aQ61495 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dsg1aQ61495 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms