Protein–RNA interactions for Protein: Q61327

Slc6a3, Sodium-dependent dopamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a3Q61327 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc6a3Q61327 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc6a3Q61327 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc6a3Q61327 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc6a3Q61327 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc6a3Q61327 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc6a3Q61327 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms