Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acvr1bQ61271 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acvr1bQ61271 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Acvr1bQ61271 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acvr1bQ61271 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Acvr1bQ61271 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms