Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep250Q60952 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep250Q60952 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep250Q60952 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep250Q60952 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep250Q60952 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep250Q60952 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep250Q60952 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep250Q60952 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep250Q60952 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms