Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grik1Q60934 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grik1Q60934 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grik1Q60934 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Grik1Q60934 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik1Q60934 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik1Q60934 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik1Q60934 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms