Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelnQ60841 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelnQ60841 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelnQ60841 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RelnQ60841 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelnQ60841 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RelnQ60841 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelnQ60841 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelnQ60841 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelnQ60841 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelnQ60841 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelnQ60841 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelnQ60841 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RelnQ60841 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelnQ60841 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelnQ60841 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms