Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf4Q60793 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf4Q60793 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf4Q60793 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf4Q60793 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf4Q60793 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf4Q60793 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms