Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms