Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip3Q60769 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip3Q60769 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip3Q60769 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip3Q60769 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip3Q60769 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip3Q60769 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip3Q60769 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfaip3Q60769 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfaip3Q60769 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms