Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc30a1Q60738 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc30a1Q60738 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc30a1Q60738 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc30a1Q60738 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms