Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Satb1Q60611 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Satb1Q60611 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Satb1Q60611 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Satb1Q60611 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Satb1Q60611 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms