Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Scaf1Q5U4C3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Scaf1Q5U4C3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scaf1Q5U4C3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scaf1Q5U4C3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Scaf1Q5U4C3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Scaf1Q5U4C3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Scaf1Q5U4C3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Scaf1Q5U4C3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Scaf1Q5U4C3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Scaf1Q5U4C3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Scaf1Q5U4C3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scaf1Q5U4C3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scaf1Q5U4C3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Scaf1Q5U4C3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Scaf1Q5U4C3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Scaf1Q5U4C3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf1Q5U4C3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Scaf1Q5U4C3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms