Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC47.9■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NacadQ5SWP3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC47.86■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
NacadQ5SWP3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC47.79■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC47.76■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
NacadQ5SWP3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NacadQ5SWP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
NacadQ5SWP3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
NacadQ5SWP3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC47.69■■■■■ 5.23
NacadQ5SWP3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NacadQ5SWP3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
NacadQ5SWP3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
NacadQ5SWP3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
NacadQ5SWP3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
NacadQ5SWP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
NacadQ5SWP3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NacadQ5SWP3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC47.56■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NacadQ5SWP3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
NacadQ5SWP3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NacadQ5SWP3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NacadQ5SWP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC47.42■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
NacadQ5SWP3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NacadQ5SWP3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NacadQ5SWP3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NacadQ5SWP3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NacadQ5SWP3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC47.33■■■■■ 5.17
NacadQ5SWP3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
NacadQ5SWP3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NacadQ5SWP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms