Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm14685Q52KH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm14685Q52KH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm14685Q52KH6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm14685Q52KH6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm14685Q52KH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms