Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opa3Q505D7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opa3Q505D7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa3Q505D7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opa3Q505D7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opa3Q505D7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms