Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdp2Q504M2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdp2Q504M2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdp2Q504M2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdp2Q504M2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdp2Q504M2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdp2Q504M2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdp2Q504M2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdp2Q504M2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdp2Q504M2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdp2Q504M2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms