Protein–RNA interactions for Protein: Q4VK74

Ifnl2, Interferon lambda-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl2Q4VK74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnl2Q4VK74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnl2Q4VK74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnl2Q4VK74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifnl2Q4VK74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ifnl2Q4VK74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnl2Q4VK74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifnl2Q4VK74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifnl2Q4VK74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnl2Q4VK74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifnl2Q4VK74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifnl2Q4VK74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms