Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne3Q4FZC9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne3Q4FZC9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syne3Q4FZC9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syne3Q4FZC9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne3Q4FZC9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms