Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clul1Q3ZRW6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clul1Q3ZRW6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clul1Q3ZRW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clul1Q3ZRW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clul1Q3ZRW6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clul1Q3ZRW6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clul1Q3ZRW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms