Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pydc3Q3V3Q4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pydc3Q3V3Q4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pydc3Q3V3Q4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pydc3Q3V3Q4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms