Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC051142Q3V0M8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BC051142Q3V0M8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BC051142Q3V0M8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BC051142Q3V0M8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC051142Q3V0M8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC051142Q3V0M8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BC051142Q3V0M8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms