Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc27Q3V036 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc27Q3V036 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc27Q3V036 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc27Q3V036 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc27Q3V036 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc27Q3V036 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc27Q3V036 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms