Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E330034G19RikQ3UWX6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330034G19RikQ3UWX6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330034G19RikQ3UWX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E330034G19RikQ3UWX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms