Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube2fbQ3UWQ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2fbQ3UWQ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2fbQ3UWQ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2fbQ3UWQ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.2 ms