Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
D130052B06RikQ3UW13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
D130052B06RikQ3UW13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D130052B06RikQ3UW13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
D130052B06RikQ3UW13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms