Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim15Q3UTD9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim15Q3UTD9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim15Q3UTD9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms