Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxred2Q3USW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxred2Q3USW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxred2Q3USW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxred2Q3USW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxred2Q3USW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxred2Q3USW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxred2Q3USW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms