Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syndig1lQ3USQ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1lQ3USQ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syndig1lQ3USQ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Syndig1lQ3USQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syndig1lQ3USQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syndig1lQ3USQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms