Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pin1rt1Q3ULQ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin1rt1Q3ULQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms