Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ceacam5Q3UKK2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ceacam5Q3UKK2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ceacam5Q3UKK2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ceacam5Q3UKK2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ceacam5Q3UKK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ceacam5Q3UKK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms