Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smu1Q3UKJ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smu1Q3UKJ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smu1Q3UKJ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smu1Q3UKJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smu1Q3UKJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smu1Q3UKJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms