Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf224Q3UIW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf224Q3UIW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf224Q3UIW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf224Q3UIW8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf224Q3UIW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf224Q3UIW8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf224Q3UIW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf224Q3UIW8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf224Q3UIW8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf224Q3UIW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf224Q3UIW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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