Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem109Q3UBX0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem109Q3UBX0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tmem109Q3UBX0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem109Q3UBX0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem109Q3UBX0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmem109Q3UBX0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem109Q3UBX0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem109Q3UBX0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms