Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfyve27Q3TXX3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfyve27Q3TXX3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfyve27Q3TXX3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfyve27Q3TXX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfyve27Q3TXX3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfyve27Q3TXX3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfyve27Q3TXX3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfyve27Q3TXX3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfyve27Q3TXX3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfyve27Q3TXX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms