Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1lQ3TTP0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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