Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
D17Wsu92eQ3TT38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
D17Wsu92eQ3TT38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D17Wsu92eQ3TT38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D17Wsu92eQ3TT38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
D17Wsu92eQ3TT38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D17Wsu92eQ3TT38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms