Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp39Q3TIX9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp39Q3TIX9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp39Q3TIX9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp39Q3TIX9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp39Q3TIX9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms