Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pi4k2aQ2TBE6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pi4k2aQ2TBE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pi4k2aQ2TBE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pi4k2aQ2TBE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pi4k2aQ2TBE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pi4k2aQ2TBE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pi4k2aQ2TBE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pi4k2aQ2TBE6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pi4k2aQ2TBE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pi4k2aQ2TBE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms